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2025/04/11

mRNAワクチン含めた治療薬開発のためのDynabeads

  • 創薬支援

SARS-CoV-2による世界的危機に対する、mRNAワクチン開発の成功を経て、今まさに世界はワクチン開発・製造の新時代を迎えています。しかしながら、mRNAワクチンの開発・製造方法の標準化にはまだ至っていません。

GMPグレードでのスケールアップ可能なmRNAの合成と精製が可能となるDynabeadsを用いたアプリケーションが開発されました。このアプリケーションは、容易で柔軟性があり、再利用可能で、研究室規模から商業規模まで対応可能です。

mRNAワクチン開発の流れとDynabeads

mRNAワクチンの開発・製造には①標的遺伝子の単離・合成、②mRNAの合成、③合成mRNAの精製、④LNP(脂質ナノ粒子)による合成mRNAのカプセル化、⑤分析と品質検査、⑥パッケージ化と保管、と多数のステップを経る必要があります(図1)。これらのステップの中で、②mRNAの合成と③合成mRNAの精製では、プラスミド複製時の大腸菌DNAや未処理DNAテンプレート、dsRNAのコンタミによる安全性の懸念、多段階で複雑な精製過程とスケールアップのための試行のための時間的コスト、高価な精製装置の購入のための経済的コスト、といった問題があります。

Dynabeadsはこれらの問題を解決することができます。②mRNAの合成では、Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcription、③合成mRNAの精製では、Dynabeads Carboxylic Acid for RNA PurificationおよびDynabeads RNA Binding Bufferを使用することで、多様なDNAテンプレートに対応しつつ、DNAテンプレートを再利用可能、かつ合成mRNAの精製をワンステップで行えることから、時間的・経済的コストを削減でき、さらにこれらはスケールアップにも対応可能です。

Dynabeads_mRNA_flow.jpg

図1

Dynabeadsを使ったmRNAの合成と精製

以下の手順で、mRNAを合成および精製します(図2)。

  1. 標的遺伝子を含むプラスミドから、ビオチン化プライマーを用いたPCR増幅、または制限酵素による切り出し後にビオチン化修飾を行い、5’末端がビオチン化された直鎖状DNAを作成。
  2. ストレプトアビジンと共有結合したDynabeadsである、Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcriptionに未精製のビオチン化直鎖状DNA溶液を加え、標的遺伝子(テンプレート)DNAをDynabeadsに固定。磁石(DynaMag)を用いてビーズを分離することで、Dynabeadsに固定化されていない未ビオチン化DNA断片や酵素を簡便に取り除くことが可能。
  3. Dynabeadsに固定されたDNAをテンプレートにして、in vitro転写を行った後、磁石を用いて、テンプレートDNAが固定されたDynabeadsを分離することで、DNase Iを使用することなく、反応液からDNAを除去され、未精製mRNA溶液が調整可能。※分離したテンプレートDNAは6回以上再利用可能
  4. Dynabeads Carboxylic Acid for RNA Purificationに未精製mRNA溶液を加え、Dynabeads RNA Binding Bufferを添加することで、合成されたmRNAのみが、Dynabeadsに結合。※磁石を用いてビーズを分離することで、余剰塩基や酵素を簡便に取り除くことが可能
  5. TEなどの溶出液で mRNAが結合したDynabeadsをインキュベートすることで、DynabeadsよりmRNAが乖離され、精製mRNA溶液を任意の濃度で調整
Dynabeads_rna_protocol.jpg

図2

パフォーマンスデータ

Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcriptionに固定されたテンプレートDNAの再利用と、反応液への漏出

DynabeadsSA_data1.jpg
DynabeadsSA_data2.jpg
DynabeadsSA_data3.jpg

図3.
PCR増幅産物2 μgあたり2 mgのDynabeads Streptavidin for In Vitro Transcriptionを加え、液量200 μg、37℃で2時間のin vitro転写を行いました。
左)6回のDynabeads‐テンプレートDNAの再利用を通して、合成mRNAの継続した高収量を示しました。
中央)6回のDynabeads‐テンプレートDNAの再利用においても、合成mRNAの高い完全性が示されました。
右)6回のDynabeads‐テンプレートDNAの再利用を通して、テンプレートDNAの混入は未精製RNA 1 μgあたりわずか60~141 pgでした。

Dynabeads Carboxylic Acid for RNA PurificationおよびDynabeads RNA Binding Bufferによる合成mRNAの回収率とタンパク質除去率

DynabeadsCA_data1.jpg
DynabeadsCA_data2.jpg
DynabeadsCA_data3.jpg

図4.
mRNA 4.1~4.8 mgあたり1 mgのDynabeads Carboxylic Acid for RNA Purificationを加えた後、全液量と等量のDynabeads RNA Binding Bufferを加え室温でインキュベートしました。
左)6回のDynabeadsの再利用を通して、合成mRNAの継続した高回収率を示しました。
中央)6回のDynabeadsの再利用を通して、合成mRNAの高い完全性が示されました。
右)タンパク質除去率は99%以上であり、フェノール/クロロホルム抽出、エタノール沈殿などの手動操作をした場合と同程度でした。

少量でのスクリーニングからスケールアップまでの自動化に対応

Dynabeadsは自動サンプル精製システムのKingFisherシリーズに対応しています。テンプレートDNAの固定からmRNAの精製までを96-wellプレートならば約3.5時間、24-wellプレートならば約4.5時間で行え、ハイスループットスクリーニングが可能です。

mRNAの大量製造にも対応でき、収量が減少すること無くスケールアップ可能です(図5)。

Dynabeads_rna_scaleup1.jpg

図5

製品情報

Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcription、Dynabeads Carboxylic Acid for RNA Purification、Dynabeads RNA Binding Bufferだけでなく、これらのセット製品も取り扱っています。

製品名 製品コード 容量 製品構成
Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcription DB65005 2 mL
DB65006 10 mL
Dynabeads Carboxylic Acid for RNA Purification DB65020 2 mL
DB65021 10 mL
Dynabeads RNA Binding Buffer DB65040 20 mL
DB65042 50 mL
Dynabeads RNA Purification Kit DB65030 1 kit Carboxylic Acid for RNA Purification (2 mL)
RNA Binding Buffer (20 mL)
DB65032 1 kit Carboxylic Acid for RNA Purification (10 mL)
RNA Binding Buffer (50 mL)
Dynabeads In Vitro Transcription and RNA Purification Kit DB65034 1 kit Carboxylic Acid for RNA Purification (2 mL)
RNA Binding Buffer (20 mL)
Streptavidin for In Vitro Transcription (2 mL)
DB65036 1 kit Carboxylic Acid for RNA Purification (10 mL)
RNA Binding Buffer (50 mL)
Streptavidin for In Vitro Transcription (10 mL)

また、GMPグレードでの大量製造に適した大容量品その他の柔軟な対応が可能です。詳しくはお問い合わせ下さい。

製品名 製品コード 容量
Dynabeads Streptavidin for In Vitro Transcription 49011D 10 mL
49010D 100 mL
Dynabeads Carboxylic Acid for RNA Purification 49021D 10 mL
49020D 100 mL
Dynabeads RNA Binding Buffer 49041D 50 mL
49040D 450 mL

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