PCR-SSO法

HLA-DNAタイピングの方法のひとつである、Polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide法のことです。

この方法では、サンプルからDNAを抽出しPCRでDNAを増幅した後、担体に固相化した各アレル特異的な配列と相補的なオリゴヌクレオチドプローブとハイブリダイゼーションさせます。プローブと二本鎖を形成したサンプルDNAを標識してシグナルを測定し、アレルを判定します。
数時間で結果を出すことができ、大量検体に対応が可能という利点があります。プローブの相補性による断片的な塩基配列の識別にもとづくため、塩基配列自体を判読するPCR-SBT法に比べると判定結果の解像度は低くなります。

現在普及している方法は、当初開発された担体にサンプルDNAを固相化する方法とは逆にプローブを固相化するように改良されているため、reverse SSO（rSSO）法と呼ばれます。

図　PCR-SSO法（rSSO法）の概要

関連リンク：HLA-DNA タイピングキット LABType

用語集五十音順メニュー アレル（allele） クロスマッチ試験 抗HLA抗体 自然抗体 ハプロタイプ プロゾーン現象 ローカス（locus） 連鎖不平衡 Bw4, Bw6 C1q、補体結合性抗体 Class IとClass II CREG（Cross Reactive Group） CWD DSA HLA-タイピング HLAMatchmaker HLAエピトープ（Epitope）、エプレット（Eplet） HLAクラスI HLAクラスII IMGT MFI、nMFI MHC PCR-SBT法 PCR-SSO法 PCR-SSP法 WHO命名委員会 ％PRA